MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR05

Total Repeats: 454

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014737	CG	5	10	50	59	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014737	G	6	6	88	93	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014737	GC	4	8	105	112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014737	CG	3	6	127	132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014737	TAC	2	6	143	148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014737	AG	4	8	172	179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014737	TC	3	6	185	190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014737	ACAGA	2	10	191	200	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014737	TTTTCT	2	12	216	227	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014737	TCT	3	9	225	233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014737	TC	3	6	258	263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014737	GGAC	2	8	269	276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014737	CG	3	6	289	294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014737	GCT	2	6	317	322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014737	AGG	2	6	374	379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014737	CACG	2	8	414	421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014737	AC	3	6	457	462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014737	GC	3	6	479	484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014737	GCC	2	6	534	539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122740
20	NC_014737	ATG	2	6	606	611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122740
21	NC_014737	TCC	2	6	615	620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122740
22	NC_014737	CGA	2	6	640	645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122740
23	NC_014737	TCG	2	6	658	663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
24	NC_014737	CGG	2	6	705	710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122740
25	NC_014737	ATC	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122740
26	NC_014737	CG	3	6	771	776	0 %	0 %	50 %	50 %	313122740
27	NC_014737	CAG	2	6	783	788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122740
28	NC_014737	GAG	2	6	794	799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122740
29	NC_014737	TCG	2	6	825	830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
30	NC_014737	TCG	2	6	864	869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
31	NC_014737	ATG	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122740
32	NC_014737	GAC	2	6	879	884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122740
33	NC_014737	GTG	2	6	887	892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122740
34	NC_014737	ACC	2	6	928	933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122740
35	NC_014737	GTC	2	6	947	952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
36	NC_014737	CGT	2	6	970	975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
37	NC_014737	GAC	2	6	1037	1042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122740
38	NC_014737	AGG	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122740
39	NC_014737	GAC	2	6	1100	1105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122740
40	NC_014737	TCC	2	6	1119	1124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122740
41	NC_014737	GCAG	2	8	1195	1202	25 %	0 %	50 %	25 %	313122740
42	NC_014737	GC	3	6	1251	1256	0 %	0 %	50 %	50 %	313122740
43	NC_014737	GTT	2	6	1271	1276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122740
44	NC_014737	GCCA	2	8	1296	1303	25 %	0 %	25 %	50 %	313122740
45	NC_014737	CGG	2	6	1331	1336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122740
46	NC_014737	CAGC	2	8	1342	1349	25 %	0 %	25 %	50 %	313122740
47	NC_014737	CCG	2	6	1359	1364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122740
48	NC_014737	GAT	2	6	1403	1408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122740
49	NC_014737	CTT	2	6	1421	1426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122740
50	NC_014737	GTC	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
51	NC_014737	CGT	2	6	1580	1585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122740
52	NC_014737	GGT	2	6	1634	1639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122740
53	NC_014737	TG	3	6	1653	1658	0 %	50 %	50 %	0 %	313122740
54	NC_014737	TCTTCC	2	12	1697	1708	0 %	50 %	0 %	50 %	313122741
55	NC_014737	CGA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122741
56	NC_014737	CGT	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122741
57	NC_014737	AGG	2	6	1853	1858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122741
58	NC_014737	GA	3	6	1866	1871	50 %	0 %	50 %	0 %	313122741
59	NC_014737	TGA	2	6	1896	1901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122741
60	NC_014737	ACG	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122741
61	NC_014737	GAG	2	6	1954	1959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122741
62	NC_014737	CTC	3	9	1960	1968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122741
63	NC_014737	CTC	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122741
64	NC_014737	GTCG	2	8	2053	2060	0 %	25 %	50 %	25 %	313122741
65	NC_014737	TTC	2	6	2105	2110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122741
66	NC_014737	AGG	2	6	2144	2149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122741
67	NC_014737	GGTC	2	8	2193	2200	0 %	25 %	50 %	25 %	313122741
68	NC_014737	TCG	2	6	2204	2209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122741
69	NC_014737	CGA	2	6	2235	2240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122741
70	NC_014737	CGA	2	6	2265	2270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122741
71	NC_014737	TCG	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122741
72	NC_014737	CCT	2	6	2322	2327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122741
73	NC_014737	CAG	2	6	2338	2343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122741
74	NC_014737	GAC	2	6	2351	2356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122741
75	NC_014737	GTC	2	6	2386	2391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122741
76	NC_014737	CGGT	2	8	2444	2451	0 %	25 %	50 %	25 %	313122741
77	NC_014737	GTC	2	6	2490	2495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
78	NC_014737	CTCTTC	2	12	2496	2507	0 %	50 %	0 %	50 %	313122742
79	NC_014737	GCA	2	6	2564	2569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122742
80	NC_014737	AAC	2	6	2584	2589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122742
81	NC_014737	TCG	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
82	NC_014737	CCT	2	6	2639	2644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122742
83	NC_014737	GC	3	6	2668	2673	0 %	0 %	50 %	50 %	313122742
84	NC_014737	GAG	2	6	2766	2771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122742
85	NC_014737	CTC	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122742
86	NC_014737	TCG	2	6	2839	2844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
87	NC_014737	GACGGT	2	12	2847	2858	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	313122742
88	NC_014737	GTC	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
89	NC_014737	GTC	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
90	NC_014737	CCA	2	6	2948	2953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122742
91	NC_014737	CGG	2	6	2969	2974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122742
92	NC_014737	CTG	2	6	3060	3065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
93	NC_014737	CGT	2	6	3074	3079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
94	NC_014737	AGA	2	6	3119	3124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122742
95	NC_014737	CG	3	6	3150	3155	0 %	0 %	50 %	50 %	313122742
96	NC_014737	TCG	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
97	NC_014737	CTC	3	9	3180	3188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122742
98	NC_014737	GCGCA	2	10	3195	3204	20 %	0 %	40 %	40 %	313122742
99	NC_014737	CCGA	2	8	3207	3214	25 %	0 %	25 %	50 %	313122742
100	NC_014737	GC	3	6	3230	3235	0 %	0 %	50 %	50 %	313122742
101	NC_014737	GCT	2	6	3240	3245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122742
102	NC_014737	CAG	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122743
103	NC_014737	AGG	2	6	3327	3332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122743
104	NC_014737	CAGC	2	8	3357	3364	25 %	0 %	25 %	50 %	313122743
105	NC_014737	GTC	2	6	3410	3415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
106	NC_014737	TCG	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
107	NC_014737	GTA	2	6	3449	3454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122743
108	NC_014737	GAT	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122743
109	NC_014737	CGT	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
110	NC_014737	CTC	2	6	3503	3508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122743
111	NC_014737	GTC	2	6	3533	3538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
112	NC_014737	CAT	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122743
113	NC_014737	TCG	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
114	NC_014737	GC	4	8	3721	3728	0 %	0 %	50 %	50 %	313122743
115	NC_014737	CG	3	6	3737	3742	0 %	0 %	50 %	50 %	313122743
116	NC_014737	CAT	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122743
117	NC_014737	GCC	2	6	3765	3770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122743
118	NC_014737	CAT	3	9	3812	3820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122743
119	NC_014737	TCG	2	6	3822	3827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
120	NC_014737	CTC	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122743
121	NC_014737	CTC	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122743
122	NC_014737	TCC	2	6	3912	3917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122743
123	NC_014737	CGT	2	6	3920	3925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122743
124	NC_014737	CTCGAC	2	12	3932	3943	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	313122743
125	NC_014737	GC	3	6	4014	4019	0 %	0 %	50 %	50 %	313122743
126	NC_014737	AGTCGA	2	12	4183	4194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313122743
127	NC_014737	GGGT	2	8	4275	4282	0 %	25 %	75 %	0 %	313122743
128	NC_014737	TTC	2	6	4331	4336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122743
129	NC_014737	TCC	2	6	4371	4376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122743
130	NC_014737	GGT	2	6	4377	4382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122743
131	NC_014737	GGT	2	6	4586	4591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014737	GGAC	2	8	4599	4606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014737	GGA	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014737	GAC	2	6	4859	4864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122744
135	NC_014737	CCG	2	6	4891	4896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122744
136	NC_014737	TGGG	2	8	4897	4904	0 %	25 %	75 %	0 %	313122744
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267	NC_014737	CAG	2	6	9599	9604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122748
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269	NC_014737	CGA	2	6	9672	9677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122748
270	NC_014737	GA	3	6	9676	9681	50 %	0 %	50 %	0 %	313122748
271	NC_014737	CGA	2	6	9689	9694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122748
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284	NC_014737	TCT	3	9	10140	10148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_014737	C	6	6	10239	10244	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
288	NC_014737	ACT	2	6	10296	10301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_014737	G	6	6	10312	10317	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
290	NC_014737	GAG	2	6	10324	10329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
291	NC_014737	ACC	2	6	10399	10404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_014737	G	6	6	10429	10434	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
293	NC_014737	GCC	2	6	10471	10476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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381	NC_014737	GGTA	2	8	14461	14468	25 %	25 %	50 %	0 %	313122755
382	NC_014737	GCT	2	6	14576	14581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122755
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385	NC_014737	GTG	2	6	14704	14709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
386	NC_014737	GGA	2	6	14730	14735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
387	NC_014737	ACC	2	6	14903	14908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122756
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390	NC_014737	TCC	2	6	15003	15008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122756
391	NC_014737	CA	4	8	15091	15098	50 %	0 %	0 %	50 %	313122756
392	NC_014737	CGA	2	6	15103	15108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122756
393	NC_014737	CGA	2	6	15157	15162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122757
394	NC_014737	CTG	2	6	15186	15191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122757
395	NC_014737	CGA	2	6	15211	15216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122757
396	NC_014737	CG	3	6	15220	15225	0 %	0 %	50 %	50 %	313122757
397	NC_014737	TCG	2	6	15255	15260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122757
398	NC_014737	AAG	2	6	15368	15373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122757
399	NC_014737	TCC	2	6	15384	15389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122757
400	NC_014737	GAC	3	9	15425	15433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122757
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402	NC_014737	TTC	3	9	15527	15535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122758
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411	NC_014737	CTC	2	6	15865	15870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122758
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415	NC_014737	TAT	2	6	16058	16063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_014737	GAC	2	6	16208	16213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122759
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439	NC_014737	CAC	2	6	16967	16972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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452	NC_014737	CGG	2	6	17364	17369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_014737	CCA	2	6	17447	17452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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